バイオインフォマティクス

生命情報学に関する基本的な理論や解析ソフトウェアの使用方法について.

アミノ酸を一文字で表記するのと同様,二次構造も一文字で表記することがある.二次構造をαヘリックス,βストランド,コイルの3種類に分けた場合は以下の3つになる.

略記詳細
Hαヘリックス
Eβストランド
Cコイル

その他に,有名な二次構造計算ソフトウェアである DSSP による分類も重要である.DSSP では二次構造を8種類に分類している.

略記詳細
Hαヘリックス
Bβブリッジ
Eβラダー
G3/10ヘリックス
Iπヘリックス
Tターン
Sベンド
Cコイル(その他)

これらを最初の3つの表記に分けると,G, H, I が最初の表の H に,E および B が最初の表の E に,それ以外の T, S, C が最初の表の C に対応する.

Hatena Google+